在生命科学与生物技术方面，以保护生物学、资源生物学和进化生物学三大学科领域为重点，形成生物区系的形成与演化、重要生物类群的起源和进化、生物多样性与保护生物学、重要资源生物可持续利用、原创性天然药物的研究5个重点优势学科。
在资源环境科学与技术研究方面，形成矿床地球化学、环境地球化学、地球深部物质研究和地质流体作用地球化学等优势学科。
在天文科学研究方面，开展天体物理、太阳物理、应用天文学等方面的研究，形成了大样本恒星演化及星族合成、恒星结构演化和恒星振动、活动星系和星系物理、太阳活动区物理及太阳活动预报、人造天体精密定位与形态识别、天文新技术方法等优势学科。
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